В 1990 г. на первых свободных выборах в Хорватии победу одержал Хорватский Демократический Союз, возглавляемый Франьо Туджманом. В ответ на растущий хорватский национализм и требования независимости страны сербы, составлявшие большинство населения в хорватской области Восточная Славония и окрестностях города Книн, объявили о создании автономной «Республики Сербская Краина».
Вслед за провозглашением независимости Хорватии хорватским парламентом 25 июня 1991 года югославская народная армия (ЮНА), большинство в которой составляли к тому моменту сербы, начала боевые действия. Армия самопровозглашённой Сербской Краины действовала в координации с ЮНА и атаковала населенные преимущественно хорватами населенные пункты в Лике и Славонии.
Начало войны ознаменовалось также началом этнических чисток, проводившихся обеими сторонами. В Сербской Краине все хорваты были убиты или изгнаны; там, где сербы составляли меньшинство, репрессиям подвергались уже они.
Колоссальный патриотический подъём в Хорватии вызвала битва за Вуковар, в ходе которой хорватские части в г. Вуковар долгое время успешно сопротивлялись многократно превосходящим, но чрезвычайно плохо организованным, силам ЮНА. Город был взят сербами лишь после трёхмесячных боёв, разрушивших город до основания. Наступление ЮНА и сил краинских сербов позволило последним поставить под свой контроль часть Славонии и Далмации, однако основную задачу, удержание Хорватии в составе СФРЮ, выполнить не удалось. Начавшиеся вскоре под эгидой ООН переговоры привели к подписанию перемирия.
Перемирие сохранялось до 1995 г., когда в ходе операции «Буря» хорватская армия за несколько дней полностью разгромила вооружённые силы «Сербской Краины» и реинтегрировала Книн и сопредельные территории в состав страны. Военная операция хорватов вызвала массовый исход сербского населения из края. После этой победы президенту Туджману было присвоено звание маршала. Оставшаяся часть «Краины» в Восточной Славонии была мирно возвращена в состав Хорватии в 1998 г, что привело к полному восстановлению границ Хорватии в том виде, в каком они существовали в СФРЮ.